Прежде всего отметим, что граждане и юридические лица свободны в установлении своих прав и обязанностей на основе договора и могут по своему усмотрению определять его условия, кроме случаев, когда содержание соответствующего условия предписано законом или иными правовыми актами (п. 2 ст. 1, п. 4 ст. 421 ГК РФ).
В соответствии с п. 1 ст. 424 ГК РФ исполнение договора оплачивается по цене, установленной соглашением сторон. При этом указанная норма не содержит положений о том, включаются ли в данную цену налоги, подлежащие уплате в соответствии с законодательством.
Такие положения отсутствуют также и в ст. 709 ГК РФ, устанавливающей порядок определения цены по договору подряда. В ней лишь указывается на то, что цена в договоре подряда включает компенсацию издержек подрядчика и причитающееся ему вознаграждение (п. 2 ст. 709 ГК РФ).
Вместе с тем сторонам при оформлении договора необходимо учитывать и положения налогового законодательства. Согласно подп. 6 п. 1 ст. 208 и п. 1 ст. 209 НК РФ доходы физических лиц в виде вознаграждения за выполненную работу признаются объектом обложения НДФЛ. Такие доходы облагаются по ставке 13% (п. 1 ст. 224 НК РФ). Согласно п. 1 ст. 226 НК РФ российские организации, от которых или в результате отношений с которыми налогоплательщик получил доходы, признаются налоговыми агентами и обязаны исчислить НДФЛ с этих доходов, удержать у налогоплательщика и уплатить в бюджет сумму налога (данное правило имеет ряд исключений, но к рассматриваемой ситуации они не относятся).
Требования ст. 226 НК РФ носят императивный характер и не могут быть изменены по соглашению сторон. Поэтому, учитывая, что сумма НДФЛ удерживается налоговыми агентами непосредственно из доходов налогоплательщика при их фактической выплате (п. 4 ст. 226 НК РФ), как правило, при заключении любой российской организацией договора с физическим лицом, не являющимся индивидуальным предпринимателем, сумма НДФЛ включается непосредственно в цену договора (см. также письмо Минфина России от 25.04.2011 № 03-04-05/3-292). При этом могут допускаться различные формулировки условия о цене договора, но размер дохода физического лица, подлежащий налогообложению, должен быть определен предельно точно.
Таким образом, в рассматриваемом случае цену договора следовало указать с учетом уплачиваемого организацией как налоговым агентом налога на доходы физических лиц.
Относительно суммы, которую следует указать в акте приема-передачи выполненных работ, отметим, что законодательство, устанавливая необходимость составления документа, удостоверяющего приемку (п. 2 ст. 720 ГК РФ), не предъявляет каких-либо требований к его содержанию. Однако, учитывая, что по смыслу ст. 720 ГК РФ заказчик, осуществляя приемку, проверяет соответствие выполненной работы договору и отсутствие в ней недостатков, при указании в акте суммы, на которую такие работы выполнены, следует указывать цену, установленную договором, при условии, что подрядчик выполнил работы качественно и в полном объеме. А как уже отмечалось, такую цену следует определять с учетом НДФЛ, подлежащего уплате налоговым агентом.